Σήμερα 5 μήνες μετά την έναρξη λειτουργίας του, εμφανίζει έντονα σημάδια κατάρρευσης ενώ ακόμη και ο αντιπρόεδρος του φορέα Κυριάκος Σουλιώτης εκπέμπει σήμα κινδύνου για την επιβίωση του ΕΟΠΥΥ, και την αύξηση του ελλείμματος της κοινωνικής ασφάλισης μέσα στο 2012. 

Γι αυτό και πρότεινε αλλαγή της χρηματοδότησης του οργανισμού με τους έχοντες να πληρώνουν περισσότερα.